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對于江、河水系，當水面寬 <50m時，只設一條中泓垂線；當水面寬50-100m時，在左右近岸有明顯水流處各設一條垂線；水面寬>100時，設左、中、右三條垂線
在一條垂線上，當水深小于5m時，只在水面下0.5m處設一個采樣點；水深不足1m處，在1/2水深處設采樣點；水深5-10m時，在水面下0.5m處和河底以上0.5m處各設立一個采樣點；當水深大于10m時，設立三個采樣點，即水面下0.5處、河底以上0.5m處以及1/2水深處各設立一個采樣點。
湖泊、水庫監測垂線上的采樣點的布設與河流相同，但如果存在溫度分層現象，應先測定不同水深處的水溫、溶解氧等參數，確定分層情況后，再決定垂線上采樣點位和數目，一般除在水面下0.5m和水底上0.5m處設點外，還要在每一斜溫分層1/2處設點
海域的采樣點也根據水深的分層設置，如水深50-100m，在表層、10m層、50m層和底層設采樣點。
監測斷面和采樣點位確定后，其所在位置應有固定的天然標志物，使每次采集的樣品都取自同一位置，保證其代表性和可比性。
（三）采樣時間和采樣頻率的確定
我國水質監測規范要求如下：
（1）飲用水源地全年采樣監測12次，采樣時間根據具體情況選定。
（2）對于較大的水系干流和中小河流，全年采樣監測的次數不得小于6次。采樣時間為豐水期、枯水期和平水期，每期采樣2次
（3）潮汐河流全年在豐、枯、平水期采樣監測，每期采樣兩天，分別在大潮期和小潮期進行。
（4）設有專門監測站的湖泊、水庫，每月采樣監測一次，全年不少于12次。
（5）背景斷面每年采樣一次，在污染可能較重的季節進行。
（6）排污渠每年采樣監測不少于三次。
（7）海水水質常規監測，每年按豐、平、枯水期或季度采樣監測2-4次
（四）采樣及監測技術的選擇
要根據監測對象的性質、含量范圍及測定要求等因素選擇設當的采樣、監測方法和技術。
（五）結果表達、質量保證及實施計劃
水質監測所得的眾多化學、物理以及生物學的監測數據，是描述和評價水環境質量，進行環境管理的基本依據，必須進行科學地計算和處理，并按照要求的形式在監測報告中表達出來。
質量保證概括了保證水質監測數據正確可靠的全部活動和措施。質量保證貫穿監測工作的全過程。
實施計劃是實施監測方案的具體安排，要切實可行，使各個環節工作有序、協調地進行。
